12月6日，韩国国家情报院院长赵太庸和第一次长洪长源出席了国会情报委员会会议，向国会情报委员会报告紧急戒严事件相关的情况。有部分韩国媒体报道称，尹锡悦总统在宣布紧急戒严时，曾亲自指示洪长源与国防部国防防谍司令吕寅兄合作，逮捕执政党国民力量党党首韩东勋等政治人士。
洪长源表示，12月3日20时22分，尹锡悦打电话告诉他，“两个小时后有重要的事情要说”，要求洪长源等待电话指示。
12月3日22点53分，在“紧急戒严”发布后，尹锡悦电话指示洪长源说：“借此机会全部抓起来，彻底清理。国情院也会给予调查权，首先帮助国防部国防防谍司令，要资金给资金，要人力给人力。”
12月6日，韩国总统府一度出面否认尹锡悦曾在宣布戒严令后指示抓捕政治人物。韩国总统府称，尹锡悦并未下令抓捕政治人物。但随即韩国总统府又撤回相关表态。
关于尹锡悦是否曾下令抓人，目前韩国政坛各方说法出现分歧。外界分析，尹锡悦是否下令抓捕政治人物或将影响执政党关于弹劾投票的倾向，进而左右弹劾案是否通过韩国国会，日后也将有可能成为“内乱罪”调查过程中重要证据。
为调查戒严风波，韩国检方6日组建特别调查本部。据悉，这是韩国检方2016年组建特别调查本部调查朴槿惠政府“崔顺实干政”事件后，时隔8年再次成立特别调查本部。
综合新华社等报道